АО «ЦТСС» разработаны проекты реконструкции предприятий судового машиностроения и морского приборостроения: ОАО «Пролетарский завод», "Знамя Октября", ОАО "Северный пресс", ОАО «Завод штурманских приборов», ОАО «Завод имени А.А. Кулакова», ОАО «Завод "Буревестник" и предприятия ЭРА.

Среди работ ПФ «Союзпроектверфь» АО «ЦТСС» – разработка проектов специализированных производств:
производство гребных винтов и судовых котлов на ОАО «Балтийский завод»;
производство нестандартизированного оборудования и СТО на Петрозаводе;
производство неметаллического судостроения на ОАО «Ленинградский судостроительный завод "Пелла" и ОАО «Средне-Невский судостроительный завод».